MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.01

Total Repeats: 820

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019733	GTGG	2	8	99	106	0 %	25 %	75 %	0 %	428308249
2	NC_019733	AAACT	2	10	154	163	60 %	20 %	0 %	20 %	428308249
3	NC_019733	TC	3	6	192	197	0 %	50 %	0 %	50 %	428308249
4	NC_019733	AGT	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308249
5	NC_019733	GTT	2	6	207	212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308249
6	NC_019733	TTG	2	6	216	221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308249
7	NC_019733	ACA	2	6	248	253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308249
8	NC_019733	CAC	2	6	263	268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308249
9	NC_019733	TGCAAA	2	12	558	569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428308250
10	NC_019733	ATTAC	2	10	587	596	40 %	40 %	0 %	20 %	428308250
11	NC_019733	CTC	2	6	597	602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308250
12	NC_019733	GTTT	2	8	697	704	0 %	75 %	25 %	0 %	428308250
13	NC_019733	GTA	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308250
14	NC_019733	ACT	2	6	790	795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308250
15	NC_019733	AAG	2	6	986	991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308250
16	NC_019733	GCA	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308250
17	NC_019733	TGA	2	6	1129	1134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308250
18	NC_019733	TAA	2	6	1209	1214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308250
19	NC_019733	TTAA	2	8	1226	1233	50 %	50 %	0 %	0 %	428308250
20	NC_019733	GCA	3	9	1576	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308251
21	NC_019733	TCA	2	6	1761	1766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308251
22	NC_019733	GCA	2	6	1787	1792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308251
23	NC_019733	AGC	2	6	1902	1907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
24	NC_019733	TCA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
25	NC_019733	GCT	2	6	1965	1970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
26	NC_019733	GAG	2	6	1978	1983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308252
27	NC_019733	AGC	2	6	1990	1995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
28	NC_019733	AT	4	8	2016	2023	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
29	NC_019733	CTG	2	6	2090	2095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
30	NC_019733	TTA	2	6	2113	2118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
31	NC_019733	ATT	3	9	2178	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
32	NC_019733	TGA	2	6	2196	2201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
33	NC_019733	TAG	2	6	2216	2221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
34	NC_019733	CTG	2	6	2264	2269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
35	NC_019733	ACA	2	6	2294	2299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
36	NC_019733	ACC	2	6	2316	2321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308252
37	NC_019733	TCTG	2	8	2368	2375	0 %	50 %	25 %	25 %	428308252
38	NC_019733	TG	3	6	2402	2407	0 %	50 %	50 %	0 %	428308252
39	NC_019733	AAGC	2	8	2437	2444	50 %	0 %	25 %	25 %	428308252
40	NC_019733	GCA	2	6	2473	2478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
41	NC_019733	ACA	2	6	2511	2516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
42	NC_019733	CGA	2	6	2607	2612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
43	NC_019733	GCT	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
44	NC_019733	ATT	2	6	2638	2643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
45	NC_019733	ATT	2	6	2700	2705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
46	NC_019733	A	6	6	2779	2784	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
47	NC_019733	A	6	6	2848	2853	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
48	NC_019733	TCAA	2	8	2876	2883	50 %	25 %	0 %	25 %	428308252
49	NC_019733	TAC	2	6	2923	2928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
50	NC_019733	TAG	2	6	2969	2974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
51	NC_019733	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
52	NC_019733	A	6	6	3051	3056	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
53	NC_019733	CAT	2	6	3071	3076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
54	NC_019733	CAA	2	6	3077	3082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
55	NC_019733	ATA	2	6	3118	3123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308252
56	NC_019733	ATTT	2	8	3218	3225	25 %	75 %	0 %	0 %	428308252
57	NC_019733	ACA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
58	NC_019733	CCAAAA	3	18	3286	3303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
59	NC_019733	AAG	2	6	3308	3313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308252
60	NC_019733	ATT	2	6	3367	3372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
61	NC_019733	ATG	2	6	3374	3379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
62	NC_019733	AT	3	6	3426	3431	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
63	NC_019733	ATC	2	6	3441	3446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
64	NC_019733	AGC	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
65	NC_019733	ATC	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
66	NC_019733	ACT	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
67	NC_019733	ACC	2	6	3579	3584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308252
68	NC_019733	A	6	6	3601	3606	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
69	NC_019733	TGC	2	6	3632	3637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
70	NC_019733	A	6	6	3655	3660	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
71	NC_019733	CTC	2	6	3698	3703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308252
72	NC_019733	TGA	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
73	NC_019733	ATGG	2	8	3915	3922	25 %	25 %	50 %	0 %	428308252
74	NC_019733	ACA	2	6	3955	3960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308252
75	NC_019733	CAT	2	6	4030	4035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
76	NC_019733	TTA	2	6	4098	4103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
77	NC_019733	TGA	2	6	4149	4154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
78	NC_019733	TTAA	2	8	4201	4208	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
79	NC_019733	A	6	6	4624	4629	100 %	0 %	0 %	0 %	428308252
80	NC_019733	CT	3	6	4638	4643	0 %	50 %	0 %	50 %	428308252
81	NC_019733	ATT	2	6	4659	4664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
82	NC_019733	AGGG	2	8	4741	4748	25 %	0 %	75 %	0 %	428308252
83	NC_019733	ATCA	2	8	4768	4775	50 %	25 %	0 %	25 %	428308252
84	NC_019733	GAG	2	6	4867	4872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308252
85	NC_019733	AGG	2	6	4901	4906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308252
86	NC_019733	GGA	2	6	4925	4930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308252
87	NC_019733	GCA	2	6	4953	4958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308252
88	NC_019733	GCT	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308252
89	NC_019733	CCAA	2	8	5075	5082	50 %	0 %	0 %	50 %	428308252
90	NC_019733	ACT	3	9	5143	5151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
91	NC_019733	GGT	2	6	5209	5214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308252
92	NC_019733	ATT	2	6	5232	5237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
93	NC_019733	TAAG	2	8	5249	5256	50 %	25 %	25 %	0 %	428308252
94	NC_019733	TA	3	6	5258	5263	50 %	50 %	0 %	0 %	428308252
95	NC_019733	TAA	2	6	5271	5276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308252
96	NC_019733	TGA	2	6	5280	5285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
97	NC_019733	TAG	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308252
98	NC_019733	TTGG	2	8	5390	5397	0 %	50 %	50 %	0 %	428308252
99	NC_019733	ATT	2	6	5413	5418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308252
100	NC_019733	CTA	2	6	5449	5454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308252
101	NC_019733	GAA	2	6	5540	5545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308252
102	NC_019733	A	6	6	5711	5716	100 %	0 %	0 %	0 %	428308253
103	NC_019733	AGA	2	6	5775	5780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308253
104	NC_019733	A	6	6	5820	5825	100 %	0 %	0 %	0 %	428308253
105	NC_019733	A	6	6	5880	5885	100 %	0 %	0 %	0 %	428308253
106	NC_019733	GTC	2	6	5964	5969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308253
107	NC_019733	CAAAAA	2	12	5983	5994	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428308253
108	NC_019733	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	428308253
109	NC_019733	TTG	2	6	6093	6098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308253
110	NC_019733	TGAT	2	8	6162	6169	25 %	50 %	25 %	0 %	428308253
111	NC_019733	ATTA	2	8	6199	6206	50 %	50 %	0 %	0 %	428308253
112	NC_019733	TAA	2	6	6227	6232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308253
113	NC_019733	GAGC	2	8	6581	6588	25 %	0 %	50 %	25 %	428308254
114	NC_019733	TCC	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308254
115	NC_019733	ACTT	2	8	6657	6664	25 %	50 %	0 %	25 %	428308254
116	NC_019733	GTT	2	6	6669	6674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308254
117	NC_019733	AACT	2	8	6692	6699	50 %	25 %	0 %	25 %	428308254
118	NC_019733	CAA	2	6	6750	6755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
119	NC_019733	T	6	6	6789	6794	0 %	100 %	0 %	0 %	428308254
120	NC_019733	CAA	2	6	6800	6805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
121	NC_019733	A	6	6	6849	6854	100 %	0 %	0 %	0 %	428308254
122	NC_019733	GGA	2	6	6897	6902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308254
123	NC_019733	AGC	2	6	6926	6931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308254
124	NC_019733	GAT	2	6	7005	7010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308254
125	NC_019733	AAG	2	6	7012	7017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308254
126	NC_019733	CTA	2	6	7157	7162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308254
127	NC_019733	AAG	2	6	7171	7176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308254
128	NC_019733	TCCCA	2	10	7275	7284	20 %	20 %	0 %	60 %	428308254
129	NC_019733	CAA	2	6	7326	7331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
130	NC_019733	CTG	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308254
131	NC_019733	ATT	2	6	7352	7357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308254
132	NC_019733	TTA	2	6	7386	7391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308254
133	NC_019733	TTG	2	6	7468	7473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308254
134	NC_019733	GTA	2	6	7530	7535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308254
135	NC_019733	ACC	2	6	7565	7570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308254
136	NC_019733	GAA	2	6	7652	7657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308254
137	NC_019733	CAA	2	6	7770	7775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
138	NC_019733	CA	3	6	7797	7802	50 %	0 %	0 %	50 %	428308254
139	NC_019733	TAA	2	6	7804	7809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308254
140	NC_019733	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308254
141	NC_019733	CAA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308254
142	NC_019733	TGT	2	6	7841	7846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308254
143	NC_019733	ATC	2	6	7921	7926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308254
144	NC_019733	CACAA	2	10	8158	8167	60 %	0 %	0 %	40 %	428308255
145	NC_019733	AT	3	6	8197	8202	50 %	50 %	0 %	0 %	428308255
146	NC_019733	AGAACC	2	12	8203	8214	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428308255
147	NC_019733	GAA	2	6	8336	8341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308255
148	NC_019733	GCA	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308255
149	NC_019733	T	6	6	8687	8692	0 %	100 %	0 %	0 %	428308256
150	NC_019733	TTTC	2	8	8738	8745	0 %	75 %	0 %	25 %	428308256
151	NC_019733	TGT	2	6	8767	8772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308256
152	NC_019733	T	6	6	8801	8806	0 %	100 %	0 %	0 %	428308256
153	NC_019733	GCTT	2	8	8860	8867	0 %	50 %	25 %	25 %	428308256
154	NC_019733	TAA	2	6	8880	8885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308256
155	NC_019733	TCT	2	6	8896	8901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308256
156	NC_019733	TCT	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308256
157	NC_019733	TGA	2	6	9030	9035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308256
158	NC_019733	AATT	2	8	9086	9093	50 %	50 %	0 %	0 %	428308256
159	NC_019733	T	6	6	9142	9147	0 %	100 %	0 %	0 %	428308256
160	NC_019733	TTA	2	6	9187	9192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308256
161	NC_019733	TTGA	2	8	9222	9229	25 %	50 %	25 %	0 %	428308256
162	NC_019733	TGACT	2	10	9267	9276	20 %	40 %	20 %	20 %	428308256
163	NC_019733	TTA	2	6	9292	9297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308256
164	NC_019733	AGT	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308256
165	NC_019733	TTGA	2	8	9327	9334	25 %	50 %	25 %	0 %	428308256
166	NC_019733	TGACT	2	10	9372	9381	20 %	40 %	20 %	20 %	428308256
167	NC_019733	GTA	2	6	9385	9390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308256
168	NC_019733	TTA	2	6	9397	9402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308256
169	NC_019733	T	6	6	9445	9450	0 %	100 %	0 %	0 %	428308256
170	NC_019733	TTA	3	9	9496	9504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308256
171	NC_019733	GA	3	6	9537	9542	50 %	0 %	50 %	0 %	428308256
172	NC_019733	TGT	2	6	9558	9563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308256
173	NC_019733	A	6	6	9585	9590	100 %	0 %	0 %	0 %	428308256
174	NC_019733	AAAG	2	8	9971	9978	75 %	0 %	25 %	0 %	428308257
175	NC_019733	CGCCA	2	10	10012	10021	20 %	0 %	20 %	60 %	428308257
176	NC_019733	ACTC	2	8	10211	10218	25 %	25 %	0 %	50 %	428308258
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179	NC_019733	CTTT	2	8	10397	10404	0 %	75 %	0 %	25 %	428308258
180	NC_019733	T	8	8	10461	10468	0 %	100 %	0 %	0 %	428308258
181	NC_019733	TAA	2	6	10560	10565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308258
182	NC_019733	TGA	2	6	10637	10642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308258
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188	NC_019733	CT	3	6	11293	11298	0 %	50 %	0 %	50 %	428308259
189	NC_019733	CCT	2	6	11300	11305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308259
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191	NC_019733	TC	3	6	11335	11340	0 %	50 %	0 %	50 %	428308259
192	NC_019733	CAGGTT	2	12	11354	11365	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428308259
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196	NC_019733	CTG	2	6	11469	11474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308259
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222	NC_019733	TGA	3	9	14616	14624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308261
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232	NC_019733	ATG	4	12	15071	15082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308261
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249	NC_019733	GCAGAA	2	12	15682	15693	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428308261
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251	NC_019733	AAG	2	6	16840	16845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308262
252	NC_019733	CCT	2	6	16866	16871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308262
253	NC_019733	AGT	2	6	16894	16899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308262
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255	NC_019733	AGC	2	6	17155	17160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308262
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257	NC_019733	ACC	2	6	17233	17238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308262
258	NC_019733	TCAAC	2	10	17265	17274	40 %	20 %	0 %	40 %	428308262
259	NC_019733	CAC	2	6	17280	17285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308262
260	NC_019733	GCA	2	6	17318	17323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308262
261	NC_019733	CTG	3	9	17334	17342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308262
262	NC_019733	ATC	3	9	17344	17352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308262
263	NC_019733	TCA	2	6	17364	17369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308262
264	NC_019733	TTC	2	6	17384	17389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308262
265	NC_019733	TCA	2	6	17456	17461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308262
266	NC_019733	CATT	2	8	17463	17470	25 %	50 %	0 %	25 %	428308262
267	NC_019733	TGC	2	6	17509	17514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428308262
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292	NC_019733	CCA	2	6	19327	19332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308263
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371	NC_019733	CCT	2	6	26094	26099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308269
372	NC_019733	TAA	2	6	26189	26194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308269
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